Identification de séquences génomiques avoisinant un gène impliqué dans la pathogénécité et protéines candidates pouvant être codées par cette région, chez le champignon Ophiostoma novo-ulmi

Abstract

The understanding of the molecular mechanisms implicated in symptom development of Dutch elm disease is of great interest for biological control of Ophiostoma novo-ulmi, the principal agent of Dutch elm disease. In this respect, the identification of virulence genes in this fungus is of prime importance. Pat1 is the only pathogenicity locus reported so far and its involvement in the virulence still needs to be confirmed. We studied genes and proteins that might be encoded by Pat1 by two different methods: chromosome walking on the aggressive strain H327 DNA and 2D gel electrophoresis of yeast-like cells. Several open reading frames were sequenced during walking including one which was coding for a high affinity ammonium transporter. In addition, we also found ten candidate peptides for Pat1 and another one for the MatA mating-type allele. Additional tests are needed to confirm the identity of Pat1 but we have provided the first genomic description of the genes located in the vicinity of the Pat1 locus and identified peptides that could be encoded by it.

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La compréhension des mécanismes moléculaires impliqués dans le développement des symptômes de la maladie hollandaise de l'orme est d'un grand intérêt pour la lutte biologique contre Ophiostoma novo-ulmi, l'agent principal de la maladie hollandaise de l'orme. À cet égard, l’identification des gènes de virulence chez ce champignon est primordiale. Pat1 est le seul locus de pathogénicité signalé jusqu'à présent et son implication dans la virulence doit encore être confirmée. Nous avons étudié les gènes et les protéines qui pourraient être codés par Pat1 par deux méthodes différentes : la marche des chromosomes sur l'ADN de la souche agressive H327 et l'électrophorèse sur gel 2D de cellules de type levure. Plusieurs cadres de lecture ouverts ont été séquencés au cours de la marche, dont un codant pour un transporteur d'ammonium de haute affinité. De plus, nous avons également trouvé dix peptides candidats pour Pat1 et un autre pour l’allèle de type sexuel MatA. Des tests supplémentaires sont nécessaires pour confirmer l'identité de Pat1, mais nous avons fourni la première description génomique des gènes situés à proximité du locus Pat1 et identifié les peptides qui pourraient être codés par celui-ci.