DIVERSIDAD GENÉTICA Y SELECCIÓN DE UNA COLECCIÓN NÚCLEO PARA LA CONSERVACIÓN A LARGO PLAZO DE CACAO (Theobroma cacao L)

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RESUMEN

Se estudiaron 99 accesiones del Banco de Germoplasma de Cacao del Campo Experimental Rosario Izapa, Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias, México, con el objetivo de evaluar la diversidad genética y así sentar las bases para un programa de conservación a largo plazo de los materiales representativos de la diversidad mediante una colección núcleo. Se utilizaron 14 marcadores microsatélites. Para analizar el polimorfismo se registró la ausencia/presencia (0/1) de bandas para cada locus y se generó una matriz binaria con la información generada con todos los cebadores; los parámetros de diversidad fueron obtenidos con el programa GenAlex 6.5 y el software utilizado para la selección de la colección núcleo fue un algoritmo basado en K-MEANS y FFT para el desarrollo de la colección núcleo CorColl ver. 2.3. Con el uso de 14 SSR se amplificaron 75 bandas, de los cuales el 79,7% fueron polimórficas. El número de alelos diferentes fue de dos para todos los cebadores, en tanto que el número de alelos efectivos varió d e 1 ,105 a 1 ,384 ( promedio= 1 ,213). E l í ndice d e S hannon mostró valores considerados muy bajos (0,167-0,407; promedio= 0,267). Lo anterior concuerda con la heterocigosidad esperada ( 0,085-0,255; p romedio= 0 ,153. S in e mbargo, c on l a diversidad observada fue posible obtener varios grupos. La colección núcleo se construyó con valores de K=16, 18, 20 y 22 y la mejor propuesta fue con K=22 debido a que representa eficientemente la diversidad de la colección original y se puede proponer para la conservación a largo plazo mediante crioconservación.

PALABRAS CLAVE / Cacaos Criollos / Cacaos Forasteros / Cacaos Trinitarios / Diversidad / Microsatélites /

Recibido: 05/02/2018. Modificado: 22/10/2018. Aceptado: 26/10/2018.

SUMMARY

Ninety-nine accessions of the Cocoa Germplasm Bank in the Rosario Izapa Experimental Station, INIFAP, Mexico, were studied in order to evaluate the genetic diversity and thus lay the foundation for a long-term conservation program of materials representative of diversity through a core collection. Fourteen microsatellite (SSR's) markers were used. To analyze polymorphism the absence/presence (0/1) of bands for each locus was recorded, and a binary matrix was generated with the information generated with all the primers. Diversity parameters were obtained with the GenAlex 6.5 program...