Structure genetique des populations du Cronartium ribicola canadiennes

Abstract

Genetic diversity in white pine blister rust has been previously described to reside mostly within cankers and within white pine natural stands or plantations for the dicaryotic aecidial stage, with very little genetic differentiation between populations observed in Quebec and British Columbia. The aim of the current study was to extend such comparisons to white pine blister rust populations from five Eastern and one Western Canadian provinces. The analysis of gene diversity using Lynch and Milligan's corrections for the dominance of RAPD markers, indicated a low level (5.8%) of genetic differentiation among populations including populations from Newfoundland and Ontario, which are separated by 3000 Km. An analysis of molecular variance revealed that most (94%, p $<$ 0.001) of the genetic variability was present within populations (mostly plantations) with minor levels of genetic differentiation among regions (0.02%, p = 0.475) or among populations (6%, p $<$ 0.001). By contrast, a significant (28%, p $<$ 0.001) level of genetic differentiation was found between one population from British Columbia (west) and three Quebec populations (east). These results suggest that there is probably an important gene flow between homogenized populations of C. ribicola populations of C. ribicola in eastern Canada, but that there is a barrier to gene flow between eastern and western populations.

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Il a déjà été décrit que la diversité génétique de la rouille vésiculeuse du pin blanc réside principalement dans les chancres et dans les peuplements ou plantations naturels de pin blanc pour le stade aecidien dicaryote, avec très peu de différenciation génétique entre les populations observées au Québec et en Colombie-Britannique. Le but de la présente étude était d'étendre ces comparaisons aux populations de rouille vésiculeuse du pin blanc de cinq provinces de l'Est et d'une province de l'Ouest du Canada. L'analyse de la diversité génétique à l'aide des corrections de Lynch et Milligan pour la dominance des marqueurs RAPD a indiqué un faible niveau (5,8 %) de différenciation génétique entre les populations, y compris les populations de Terre-Neuve et de l'Ontario, séparées par 3 000 km. Une analyse de la variance moléculaire a révélé que la majeure partie (94 %, p $<$ 0,001) de la variabilité génétique était présente au sein des populations (principalement des plantations) avec des niveaux mineurs de différenciation génétique entre les régions (0,02 %, p = 0,475) ou entre les populations ( 6%, p$<$0,001). En revanche, un niveau significatif (28 %, p $<$ 0,001) de différenciation génétique a été observé entre une population de la Colombie-Britannique (ouest) et trois populations du Québec (est). Ces résultats suggèrent qu'il existe probablement un flux génétique important entre les populations homogénéisées de C. ribicola de C. ribicola dans l'est du Canada, mais qu'il existe un obstacle au flux génétique entre les populations de l'est et de l'ouest.