Identification et analyse de marqueurs génétiques diagnostiques de deux champignons de rouille des pins durs (Cronartium comptoniae et Peridermium harknessii) et identification d'un hyperparasite de ces rouilles au Québec

Abstract

Fungi responsible for rust of two-needle pines cause serious problems in the province of Québec because of their negative actions on tree growth and thus on the economic value of our forest. The development of molecular diagnostic tools for these pathogens should help us, in the future, to detect infected seedlings before symptoms become visible. This will help to avoid the sending of infected seedlings on the field and thus the propagation of rust pathogens. Two species of rust fungi are described in this study, the autoecious rust Peridermium harknessii and the heteroecious rust Cronartium comptoniae. Molecular markers diagnostic for each species were developed with the ribosomal DNA region ITS 1 and the coding gene of Actin. In the course of this investigation on rust DNA, another fungus was isolated and described since its DNA was found in several samples. This fungus, Cladosporium tenuissimum, is a hyperparasite of rust fungi and is described for the first time associated with rust fungi in North America.

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Les champignons responsables de la rouille des pins à deux aiguilles causent de sérieux problèmes au Québec en raison de leurs actions négatives sur la croissance des arbres et donc sur la valeur économique de notre forêt. Le développement d’outils de diagnostic moléculaire de ces pathogènes devrait nous aider, à l’avenir, à détecter les plants infectés avant que les symptômes ne deviennent visibles. Cela permettra d’éviter l’envoi de plants infectés au champ et ainsi la propagation d’agents pathogènes de la rouille. Deux espèces de champignons de la rouille sont décrites dans cette étude, la rouille autoïque Peridermium harknessii et la rouille hétérooïque Cronartium comptoniae. Des marqueurs moléculaires diagnostiques pour chaque espèce ont été développés avec la région d'ADN ribosomal ITS 1 et le gène codant de l'Actine. Au cours de cette enquête sur l'ADN de la rouille, un autre champignon a été isolé et décrit puisque son ADN a été trouvé dans plusieurs échantillons. Ce champignon, Cladosporium tenuissimum, est un hyperparasite des champignons de la rouille et est décrit pour la première fois associé aux champignons de la rouille en Amérique du Nord.